在珊瑚海海战之后，赵继统和山本五十六策划了一个庞大的“中途岛作战计划”，其意图在于进一步摧毁美军舰队以便日本海军可以在太平洋岛链上专心巩固防御。

    山本认为必须尽早进行这类决定性战役。

     该战役计划包括一次佯攻作战:派遣第五舰队(包括轻型航母两艘，巡洋舰五艘，驱逐舰十三艘，运输船四艘)进攻阿留申群岛，空袭荷兰港并进一步入侵基斯卡岛和阿图岛，山本相信这次攻击足以将美国舰队--可能包括航母--从珍珠港吸引到北方。

    这次作战其实是山本为换取军令本部的支持而发动的与中途岛作战平行的作战行动。

     当第五舰队攻击阿留申群岛时，第一突击编队(包括舰队航母四艘，战列舰二艘，巡洋舰三艘，驱逐舰十二艘)将对中途岛发动空袭并摧毁后者的空中力量。

    上述行动完成后，第二舰队(轻型航母一艘，战列舰二艘，巡洋舰十艘，驱逐舰二十一艘，运兵船十一艘)将派出5000步兵从美国海军陆战队手中夺取中途岛环礁。

    上述对中途岛的占领行动会将美国航母编队重新吸引向西方，而第一突击编队将设下埋伏将它们歼灭。

     此后，第一舰队(轻型航母一艘，战列舰七艘，巡洋舰三艘，驱逐舰十三艘)将与第二舰队的部分兵力会合，共同将剩余的美国海军太平洋舰队兵力聚歼。

    为应对突发情况，山本设置了两项预警措施。

    第一项是派出海军重型水上飞机川崎二式大艇对珍珠港进行远程空中侦察，确保美军航母正在港内待命，称为“k作战”；第二项是设置潜艇防线，以便在美军航母前往中途岛时尽早向第一突击编队、第一舰队和第二舰队通报敌方的行动。

     但实际上，空中侦察行动因故取消（后详），潜艇也推迟到美军航母已经出击后方才就位。

    中途岛战役的作战计划制定过程充满妥协和匆忙(为赶在对马海峡海战纪念日暨日本海军节当日派出舰队）但在日军看来，计划本身颇为周详，组织严密，时机掌握得也很好。

     相对于日军计划投